免疫共沉淀结合质谱技术蛋白互作
免疫共沉淀（co-inmunoprecipitation, Co-IP）技术是逐渐成为研究蛋白-蛋白间相互作用主要方法和手段，以细胞内源性靶蛋白为诱饵，将靶蛋白抗体与细胞总蛋白进行共孵育
蛋白质谱测序
用 Nano-LC-ESI-MS/MS蛋白鉴定技术和Label-Free定量技术对蛋白凝胶样本（SDS-PAGE样本）、IP、co-IP、Pull-down等纯化溶液样本进行蛋白鉴定。
SWATH蛋白定量（蛋白质组）
SWATH（Sequential Window Acquisition of all Theoretical fragmentions）定量技术
电荷异质体纯度CIEF分析
对样品进行cIEF等点聚焦，而后对主峰纯度进行积分，得出样品电荷异质体纯度。样品平行3针，每针积分得出主峰纯度值，当RSD≤5%时，报告平均值。